Świątynia w miejscowości Witkowo Drugie stanowi filię parafii Zwiastowania Pańskiego w Witkowie Pierwszym. Do czasu powstania w latach dziewięćdziesiątych XX wieku nowego budynku kościoła, pełniła funkcje parafialne. Tu po II wojnie światowej koncentrowało się życie nowej wspólnoty przesiedlonej z Wileńszczyzny. Kościół został poświęcony dnia 29 lipca 1945 roku przez pierwszego proboszcza - księdza Edwarda Gagajka z Towarzystwa Chrystusowego dla Polonii Zagranicznej.
Kościół powstał w XV wieku z użyciem cegły i kamienia, co jest dla tych terenów charakterystyczne.
Obecnie jest to sala na planie prostokąta z dwupołaciowym dachem. Program architektoniczny wschodniego szczytu jest naśladownictwem wystroju wieży północnej kościoła Najświętszej Maryi Panny w Stargardzie. Są to rozczłonkowane, ostrołukowe blendy z rozetami w ich archiwoltach.
Ponadto na krawędzi szczytu umieszczono sterczyny i joannicki krzyż z inskrypcją łacińską na każdym ramieniu. W końcu wieku XV od strony zachodniej dobudowano kamienno-ceglaną wieżę na planie kwadratu. Wewnątrz warto obejrzeć ołtarz z XVIII wieku, emporę organową z XVII wieku oraz płytę nagrobną Christiana Lupke i jego małżonki datowaną na 1751 rok.
